Diarrhée tous les matins : que se passe-t-il ?
- clara blondel
- 24 mai
- 4 min de lecture
Comprendre les causes et retrouver un confort digestif grâce à la naturopathie
Vous commencez chaque journée par un passage en urgence aux toilettes ? Vous ressentez des gargouillis, des ballonnements ou une impression de "trop plein" dès le réveil ? Avoir la diarrhée tous les matins n’est pas normal, même si cela devient une habitude. Derrière ce symptôme se cache souvent un déséquilibre digestif ou nerveux qu’il est possible de corriger avec une approche naturelle et globale.
Je vous propose ici un éclairage pour comprendre ce phénomène, et des solutions concrètes pour vous en libérer durablement.
Pourquoi ai-je la diarrhée tous les matins ?
Le matin, votre corps "redémarre" : les hormones du réveil, le péristaltisme intestinal et les premières prises alimentaires ou hydriques relancent les fonctions digestives. Chez certaines personnes, cette relance est excessive, désordonnée, voire inflammatoire.
Résultat : selles liquides, impérieuses, parfois accompagnées de gargouillis ou de douleurs abdominales.
Les causes fréquentes de la diarrhée matinale
1. Déséquilibre du microbiote intestinal (dysbiose)
Une flore intestinale déséquilibrée (suite à une alimentation inadaptée, au stress, à la prise d'antibiotiques ou à des intolérances) peut favoriser des fermentations nocturnes. Cela se manifeste au réveil par un "nettoyage" intestinal : gaz, bruits digestifs, selles liquides.
2. Prolifération bactérienne dans l’intestin grêle (SIBO)
Le SIBO est un excès de bactéries dans une zone normalement peu colonisée. Il provoque des fermentations trop précoces, des ballonnements, des gargouillis constants, et souvent une diarrhée matinale liée au cycle de nettoyage intestinal nocturne.
3. Intolérances alimentaires (gluten, lactose, FODMAPs…)
Certains aliments peuvent être mal digérés et provoquer des réactions fermentaires ou inflammatoires. Le gluten ou le lactose, pris au dîner ou en soirée, peuvent déclencher une réaction éliminatrice au réveil.
4. Syndrome de l’intestin irritable (SII)
C’est une cause fréquente, surtout chez les personnes stressées, anxieuses ou hypersensibles. L’intestin est plus réactif aux stimulations : le réveil, la pression de la journée, ou même le premier repas suffisent à déclencher une diarrhée réflexe.
5. Déséquilibre hormonal (règles, SPM)
Certaines femmes souffrent davantage de diarrhée en période prémenstruelle ou pendant les règles. Cela est dû aux prostaglandines, hormones qui provoquent des contractions de l’utérus… mais aussi des intestins. Ce phénomène est naturel, mais peut être accentué par un terrain inflammatoire ou une flore intestinale déséquilibrée.
Que faire en naturopathie ?
La bonne nouvelle : il est tout à fait possible de rétablir un équilibre digestif en agissant sur l’alimentation, le microbiote, le système nerveux et, si besoin, l’équilibre hormonal. Voici ma stratégie, qui serait à individualiser par la suite pour mieux vous correspondre :
Étape 1 – Apaiser et reposer le système digestif
Pendant 7 à 10 jours, on supprime les principaux irritants pour apaiser la muqueuse :
Sans gluten, sans lactose, sans crudités, sans sucre raffiné, sans café à jeun
Aliments à privilégier : légumes cuits, riz, carottes, banane mûre, compote, viande blanche, bouillon, tisane
Objectif : calmer les fermentations, réduire l'inflammation, rééquilibrer la flore.

Étape 2 – Réguler le transit avec le psyllium blond
Le psyllium est une fibre douce, non irritante, qui agit comme une éponge dans l’intestin :
En cas de diarrhée, il absorbe l’excès d’eau et normalise la consistance des selles
Il tapisse la muqueuse, apaise les irritations et soutient le microbiote
Mode d’emploi :
Commencer par 1 cuillère à café dans un grand verre d’eau le matin ou en milieu d’après-midi
Augmenter progressivement jusqu’à 1 cuillère à soupe si bien toléré
Boire suffisamment d’eau dans la journée pour éviter les lourdeurs
Étape 3 – Rééquilibrer la flore intestinale
Après avoir calmé l’intestin, on peut travailler sur le microbiote avec :
Probiotiques
Plantes régulatrices : fenouil, mélisse, gingembre, anis
En cas de forte dysbiose ou de SIBO avéré, des extraits comme le pépin de pamplemousse ou le neem peuvent être utilisés sous accompagnement.
Étape 4 – Soutenir la muqueuse et la digestion
Certains compléments renforcent les défenses intestinales :
L-glutamine : répare la barrière intestinale
Enzymes digestives : utiles si digestion lente ou incomplète
Chardon-Marie, artichaut, radis noir : en soutien du foie, notamment en cas de troubles liés au cycle menstruel
Étape 5 – Agir sur le stress et le système nerveux
L’axe cerveau-intestin est fondamental. En cas de stress chronique, il faut :
Mettre en place une routine de cohérence cardiaque (3 x 5 min/jour)
Utiliser des plantes comme la rhodiola, le griffonia, ou l’ashwagandha
Recharger les réserves de magnésium, en privilégiant les formes douces (bisglycinate, glycérophosphate)
Et si cela ne passe pas ?
Il est essentiel de consulter un professionnel de santé si :
Les troubles persistent malgré les ajustements
Il y a du sang dans les selles, une perte de poids ou une fatigue importante
Vous avez des antécédents familiaux de maladie cœliaque, MICI, ou pathologies digestives
En conclusion
La diarrhée matinale n’est pas anodine. Elle est souvent le reflet d’un déséquilibre digestif, nerveux ou hormonal, mais elle peut être soulagée durablement avec une approche globale, individualisée et respectueuse du corps.
Chaque cas est unique. En consultation, nous identifions ensemble les leviers les plus efficaces pour vous aider à retrouver un confort digestif stable, de l’énergie et une meilleure qualité de vie au quotidien.
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